引起花卉病害的原因大體上有兩種：
一：栽培環境條件不良，如水分過多或不足，光照過強或過弱，溫度過高或過低，營養不足或失調，以及煙塵、有害氣體污染等引起的病害，這也叫生理病害。這類病害影響花卉生長發育，但不傳染。
二：由病原物浸染引起的傳染性病害(病原物有真菌、細菌、病毒等)，其中以真菌感染和細菌感染的病害最常見。這類病害在適宜的環境條件下，能迅速蔓延傳染。
常見的生理病害有：
夏季強光照射引起的灼傷
冬季低溫造成的凍傷
水分過多導致的爛根
水分不足發生葉片焦邊或萎蔫
土壤中缺乏某些營養元素，缺氮引起老葉大量變黃
缺磷則在葉色正常的情況下到期不開花，缺鉀則發生大量落葉以致整株衰枯
施肥過量或施未經腐熟的有機肥，導致嫩尖枯焦
水土偏堿使喜酸類植物的葉子變黃脫落
水土偏酸使喜堿類植物衰弱葉片枯焦
對于環境條件不良引起的生理性病害，只要及時地改善栽培管理，適應花卉生長發育的要求，一般會自然復壯。
常見的傳染性病害有：
葉斑病
多為害葉片，是球根秋海棠類植物普遍發生的一種葉部病害，也為害白蘭、魚尾葵、美人蕉、紫薇、貼梗海棠、日本海棠、桂花、杜鵑、鳳仙花、天竺葵、雞冠花等多種花木。病狀為葉片上局部細胞壞死，因而表現出不同的斑點癥狀，常見的有角斑、條斑、圓斑，呈灰、黑、褐等色。嚴重時葉片變黃、焦枯、脫落。
白粉病
多為害花木的嫩梢、嫩芽、嫩葉和花蕾。主要為害薔薇、玫瑰、月季、梅花等植物。發病初期，受害部位出現褪綠斑點，以后逐漸變成白色粉斑，猶如覆蓋一層白粉;后期病斑變成灰色。受害植株日漸矮小，嫩梢彎曲，葉片凹凸不平，花少而小或不能綻放或花形畸變。嚴重時葉片卷縮、干枯，甚至整株枯死。應適當增施磷、鉀肥，停止噴葉面水。
炭疽病
主要為害葉片，也能侵染莖、嫩梢、花蕾和果實等部位，多為害蘭花、君子蘭、三色堇、仙客來、金魚草、白蘭、玉蘭、八仙花等多種植物。大多數植株受害后，從葉頭和葉邊緣開始發病，葉面上出現近圓形斑點，病斑邊緣多呈紫褐色或暗褐色，中央為淡褐色或灰白色，后期病斑上有黑色小點，常排列成輪紋狀，發病嚴重時葉片枯死。應加強通風透光，停止噴葉面水。
灰霉病
主要為害葉、莖、花和果實，多為害牡丹、仙客來、四季報春、翠菊、山茶等多種植物。發病初期出現水漬狀斑點，以后逐漸擴大，變成褐色或紫褐色病斑，天氣潮濕時病斑上長出灰色茸毛，發病嚴重時整株死亡。
細菌性軟腐病
細菌侵染根莖、球莖、鱗莖、塊根等營養器官，多為害馬蹄蓮、百合、唐菖蒲、鳶尾、仙客來、風信子、君子蘭、大麗花等花卉。通常受害部位初呈水漬狀，后變成褐色，隨即粘滑軟腐，并在濕度大的情況下變成一包腐臭的漿湯，在干燥情況下變成粉狀干癟的東西。
銹病
銹病是花卉和樹木較常見和嚴重的一種病，主要危害薔薇科、豆科、百合科、禾本科、松科、柏科和楊柳科等近百種花卉苗木。病株大量出現銹色孢子堆，在葉、莖等部位先出現淡綠色小斑點，后擴大成銹褐色皰斑，表皮破裂后散發出黃褐色粉狀物，為夏孢子堆。有的呈橘紅色到黑色小粉堆，為冬孢子堆。有的呈蜜黃色到暗褐色點或粒狀，為性孢子器。發病后蒸騰和呼吸作用加速，光合作用弱，生長勢減弱，葉片提早發黃脫落。
傳染性病害需及時治療，防止其蔓延傳染，針對以上病害，在發病初期使用葉病靈1000-1500倍液噴施，能快速殺滅病菌，阻斷病害傳播;發病嚴重時可提高到800-1000倍液噴施。另外白粉病和銹病的發生，還可噴施專用藥劑粉銹克將其根除，發病初期1500-2000倍液噴施，病害爆發嚴重時1000-1500倍液噴施即可。
